まず、単純な株式売買スキームの場合は、会社が持っている債務ごと売られますので、すべて買い手が引き取ってくれます。

ヨコの会社分割スキームでは、M&A対象にするか否かを選べます。M&A対象にしない場合、その額だけM&A価格が上がります。ただし、M&A対象にした方が手続面も税務面もメリットがありますし、事業がなくなる会社に移転させようにも債権者が認めてくれませんので、普通は単純な株式売買スキームと同様に買い手が引き取ります。

事業譲渡またはタテの会社分割スキームもM&A対象にするか否かを選べますが、M&A対象にすると手続が大変な割に特にメリットありませんので、M&A対象には含めずにその分のお金をM&A対価としてもらうことが多いです。このスキームでは、特に税金面で優劣はありません。

事業譲渡またはタテの会社分割スキームの場合、売り手側でM&A対価から借金を返済するのですが、M&Aには税金が発生することを忘れないようにしましょう。もらったお金をすべて借金返済に回してしまい、納税資金がなくなることがないようにしてください。